Простое дело и не сложное дело, если первичка в порядке (подписаны акты выполненных работ, справки КС-2 и КС-3).
Откройте ст. 125, 126 АПК РФ и пишите по ним иск. Не забудьте посмотреть в договоре подсудность.
Срок исковой давности прерывается действиями должника о признании долга. Будь то...