А почему бы не принять сколько дают?
Вывести коровушек, в акте приема-передачи указать, что приняли меньше, а часть вообще хромые, убогие и без бирок.
Потом уже считайте предполагаемые убытки (от недостачи товара, отсутствие бирок и прочего).
Я с КРС не знаком, но если бы я покупал фантики, то я бы так и сделал. Принял бы сколько есть, а за мятые фантики предъявлял убытки.
Никто мне мятые фантики не разгладит, даже в присутствии полиции.
Если вы приняли коров, то вы их собственник, вы сможете и сделать вет свидетельство. Предлагаю уже смириться с тем, что КУ этого не сделает.