Надо сразу заявлять о хищении.
1) ГИБДД по запросу предоставляет данные т/с, ПТС
2) В полицию направляется заявление, где указывается, что контора - собственник т/с, вот вам в доказательство ПТС-ки, где теперь эти авто не имеем представления, найдите воров.